54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1947 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  37.09 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  30.79 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  30.13 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1630  hypothetical protein  30.69 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000438576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2684  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  28.12 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  29.54 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  29.79 
 
 		 338 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  34.53 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  27.83 
 
 		 324 aa  96.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3010  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  25.98 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  29.75 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2142  aminopeptidase  29.17 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0659  hypothetical protein  25.83 
 
 		 376 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120549  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  30.1 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  26.55 
 
 		 347 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3641  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  27.56 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266351  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  29.45 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0511  hypothetical protein  27.36 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3024  hypothetical protein  28.23 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  27.5 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3281  hypothetical protein  25.88 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.693559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1567  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  26.18 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1280  aminopeptidase  31.71 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  25.73 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  28.76 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  29.14 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  27.27 
 
 		 352 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3163  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  30.89 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  26.92 
 
 		 346 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  26.04 
 
 		 375 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  26.04 
 
 		 375 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  26.92 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  26.92 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  26.92 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1076  peptidase M29 aminopeptidase II  24.54 
 
 		 352 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  25.16 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  26.14 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  25.32 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  25.16 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  25.16 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  27.88 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  28.03 
 
 		 361 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  23.72 
 
 		 357 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_782  aminopeptidase  27.01 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0911  aminopeptidase protein  26.15 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0175579  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0795  peptidase M29, aminopeptidase II  27.7 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  22.31 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2255  peptidase M29 aminopeptidase II  24.76 
 
 		 388 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0278  peptidase M29 aminopeptidase II  25.3 
 
 		 367 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2014  peptidase M29 aminopeptidase II  25.49 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2391  putative aminopeptidase  25 
 
 		 370 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.982861  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  24.49 
 
 		 367 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  23.03 
 
 		 365 aa  42.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>