35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4039 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  99.71 
 
 		 346 aa  698    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  99.71 
 
 		 346 aa  701    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  95.66 
 
 		 346 aa  677    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  79.59 
 
 		 350 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  74.05 
 
 		 359 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  70.93 
 
 		 361 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  70.92 
 
 		 346 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  69.77 
 
 		 361 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  65.01 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  54.84 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  55.13 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  55.13 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  55.43 
 
 		 350 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  55.43 
 
 		 350 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6046  hypothetical protein  43.56 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  24.75 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  27.75 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  27.73 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  30.24 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  23.15 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  30.14 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  29.17 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  29.84 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  26.58 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  27.84 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  26.92 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  27.71 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  24.17 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1630  hypothetical protein  24.06 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000438576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0659  hypothetical protein  28.04 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3024  hypothetical protein  27.18 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0511  hypothetical protein  27.5 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2142  aminopeptidase  24.87 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3641  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  25.82 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>