33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4327 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  99.42 
 
 
346 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  99.71 
 
 
346 aa  701    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  95.95 
 
 
346 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  79.88 
 
 
350 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  74.34 
 
 
359 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  70.93 
 
 
361 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  70.62 
 
 
346 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  69.77 
 
 
361 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  65.01 
 
 
347 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  54.55 
 
 
352 aa  388  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  55.43 
 
 
350 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  55.13 
 
 
350 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  55.13 
 
 
350 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  55.43 
 
 
350 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6046  hypothetical protein  43.56 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  24.75 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  30.73 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  27.73 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  27.66 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  23.44 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  30.14 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  29.17 
 
 
316 aa  61.6  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  29.84 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  26.16 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  27.84 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  26.92 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  24.64 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  27.71 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1630  hypothetical protein  24.06 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000438576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0659  hypothetical protein  27.57 
 
 
376 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3641  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  25.82 
 
 
374 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266351  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2142  aminopeptidase  24.87 
 
 
320 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>