35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3945 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  731    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  96.57 
 
 		 350 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  99.71 
 
 		 350 aa  730    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  731    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  81.61 
 
 		 352 aa  606  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  56.73 
 
 		 350 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  54.55 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  55.43 
 
 		 346 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  55.43 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  51.71 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  55.43 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  53.25 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  55.43 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  51.14 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  52.05 
 
 		 347 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6046  hypothetical protein  47.49 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  24.85 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  31.55 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  27.37 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  24.24 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  24.55 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  24.83 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  27.36 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  25.79 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2684  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  24.34 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  27.45 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  26.26 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  22.78 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  28.72 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3010  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  24.87 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2142  aminopeptidase  23.68 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  25.16 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3024  hypothetical protein  25.69 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0682  hypothetical protein  28.57 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0599136  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1630  hypothetical protein  22.05 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000438576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>