32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3930 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  93.07 
 
 		 361 aa  699    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  744    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  77.26 
 
 		 359 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  74.34 
 
 		 350 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  70.93 
 
 		 346 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  70.35 
 
 		 346 aa  511  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  70.93 
 
 		 346 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  70.64 
 
 		 346 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  68.66 
 
 		 346 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  62.03 
 
 		 347 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  53.37 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  51.14 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  50.86 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  51.14 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  50.57 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6046  hypothetical protein  46.3 
 
 		 344 aa  288  9e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  26.96 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  25.19 
 
 		 347 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  26.59 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  24.47 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  27.13 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  29.27 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  26.5 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  24.42 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  25.25 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  24.87 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  25.87 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3024  hypothetical protein  27.32 
 
 		 374 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3010  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  25.25 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  28.03 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  25.37 
 
 		 318 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3641  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  23.76 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>