30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0216 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  76.65 
 
 		 350 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  75.45 
 
 		 359 aa  534  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  70.62 
 
 		 346 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  70.33 
 
 		 346 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  70.62 
 
 		 346 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  70.92 
 
 		 346 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  68.66 
 
 		 361 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  67.75 
 
 		 361 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  62.57 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  54.46 
 
 		 352 aa  388  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  54.17 
 
 		 350 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  53.25 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  53.55 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  53.25 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6046  hypothetical protein  43.64 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  25.81 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  25.96 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  26.14 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  24.93 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  23.12 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  26.7 
 
 		 317 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  25.87 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  25.51 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  29.14 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  25.85 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  24.87 
 
 		 316 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0659  hypothetical protein  26.19 
 
 		 376 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120549  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  25 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  24.8 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>