46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0394 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  720    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0682  hypothetical protein  34.35 
 
 
342 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0599136  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  29.1 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  26.59 
 
 
319 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  27.66 
 
 
316 aa  95.9  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1630  hypothetical protein  27.19 
 
 
313 aa  93.2  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000438576  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  24.85 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  26.55 
 
 
329 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  24.11 
 
 
352 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3010  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  26.38 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  24.85 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  24.85 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  24.85 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  25 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  28.05 
 
 
318 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  24.55 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  26.3 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2142  aminopeptidase  24.92 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  25.07 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  26.46 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2684  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  22.69 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  25.19 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  25.47 
 
 
316 aa  67  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  23.44 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  24.44 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  23.15 
 
 
346 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  24.93 
 
 
346 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  26.8 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  27.36 
 
 
350 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6046  hypothetical protein  24.71 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  28.57 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  26.57 
 
 
359 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  23.22 
 
 
324 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2842  aminopeptidase  20.94 
 
 
374 aa  53.5  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.180088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0511  hypothetical protein  29.51 
 
 
476 aa  52.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  27.41 
 
 
347 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  29.5 
 
 
370 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4137  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  25.47 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0659  hypothetical protein  25.33 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120549  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  23.22 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5702  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  25.11 
 
 
344 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696134  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  30.06 
 
 
367 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1842  peptidase M29 aminopeptidase II  23.32 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1594  peptidase M29, aminopeptidase II  24.88 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000189753  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1909  peptidase M29, aminopeptidase II  24.06 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  28.65 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>