12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0682 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0682  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0599136  normal  0.998213 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  34.35 
 
 
347 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  29.27 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  25.07 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  25.16 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1630  hypothetical protein  24.12 
 
 
313 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000438576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  28.09 
 
 
316 aa  46.2  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  25.47 
 
 
352 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  28.57 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  28.57 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  28.57 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  26.7 
 
 
324 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>