33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2138 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  96.57 
 
 		 350 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  734    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  96.57 
 
 		 350 aa  715    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  96.57 
 
 		 350 aa  714    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  81.9 
 
 		 352 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  56.14 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  53.96 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  54.17 
 
 		 346 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  55.13 
 
 		 346 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  55.43 
 
 		 346 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  55.13 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  55.13 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  50.57 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  50.57 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  51.17 
 
 		 347 aa  346  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6046  hypothetical protein  47.34 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  28.23 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  24.55 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  27.75 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  23.86 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  22.63 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  24.5 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  25.98 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  26.77 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  25.91 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  26.96 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  23.55 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2684  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  22.01 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  28.08 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2142  aminopeptidase  24.08 
 
 		 320 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  25.32 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3010  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  23.86 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3024  hypothetical protein  25.69 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>