68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3024 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3024  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  751    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3641  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  72.19 
 
 
374 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000266351  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0511  hypothetical protein  71.66 
 
 
476 aa  545  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3281  hypothetical protein  65.08 
 
 
409 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.693559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0659  hypothetical protein  58.71 
 
 
376 aa  448  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  41.2 
 
 
316 aa  190  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  35.35 
 
 
319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  42.98 
 
 
309 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  31.55 
 
 
315 aa  156  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3010  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  39.91 
 
 
314 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2142  aminopeptidase  39.13 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  37.93 
 
 
316 aa  135  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  38.14 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  36.91 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2684  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  31.11 
 
 
313 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  35.81 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  34.39 
 
 
317 aa  116  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  31.87 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1630  hypothetical protein  32.74 
 
 
313 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000438576  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1567  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  26.87 
 
 
321 aa  87.8  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1947  hypothetical protein  26.67 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3163  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  37.1 
 
 
330 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  32.96 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  31.84 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1076  peptidase M29 aminopeptidase II  31.64 
 
 
352 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0741  peptidase M29 aminopeptidase II  30.04 
 
 
363 aa  63.2  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5702  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  30.36 
 
 
344 aa  62.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0696134  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2666  peptidase M29 aminopeptidase II  28.95 
 
 
373 aa  60.1  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2642  peptidase M29 aminopeptidase II  26.09 
 
 
366 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  30.51 
 
 
388 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0257  peptidase M29 aminopeptidase II  33.33 
 
 
359 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0129156 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  31.84 
 
 
357 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2255  peptidase M29 aminopeptidase II  30.61 
 
 
388 aa  56.6  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1311  peptidase M29 aminopeptidase II  27.88 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000144193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2973  peptidase M29 aminopeptidase II  27.88 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000872397 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1834  peptidase M29 aminopeptidase II  26.27 
 
 
366 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  27.98 
 
 
365 aa  52.8  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0278  peptidase M29 aminopeptidase II  27.44 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  25.35 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0795  peptidase M29, aminopeptidase II  26.02 
 
 
389 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0432  peptidase M29 aminopeptidase II  30.86 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_782  aminopeptidase  26.02 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  25.87 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  25.95 
 
 
352 aa  50.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  27.32 
 
 
361 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3002  peptidase M29 aminopeptidase II  25.4 
 
 
374 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0261294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  25.28 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2842  aminopeptidase  25 
 
 
374 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.180088  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0911  aminopeptidase protein  25.42 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0175579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1909  peptidase M29, aminopeptidase II  25.29 
 
 
368 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.216085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3114  peptidase M29 aminopeptidase II  26.11 
 
 
367 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185719  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1280  aminopeptidase  28.28 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1777  peptidase M29 aminopeptidase II  27.44 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3265  peptidase M29, aminopeptidase II  25.62 
 
 
304 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1544  peptidase M29 aminopeptidase II  25.57 
 
 
371 aa  46.2  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  27.37 
 
 
350 aa  46.2  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2014  peptidase M29 aminopeptidase II  25.35 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  27.5 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  26.67 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  25.69 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1594  peptidase M29, aminopeptidase II  28.82 
 
 
368 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000189753  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  25.69 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  25.69 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  25.69 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3459  putative aminopeptidase  24.21 
 
 
371 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2115  peptidase M29, aminopeptidase II  24.27 
 
 
367 aa  43.9  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4511  peptidase M29 aminopeptidase II  24.4 
 
 
371 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>