146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1168 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1168  peptidase M29, aminopeptidase II  100 
 
 
388 aa  780    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.712634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06890  aminopeptidase protein  44.02 
 
 
368 aa  341  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3114  peptidase M29 aminopeptidase II  45.36 
 
 
367 aa  336  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.185719  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_782  aminopeptidase  46.2 
 
 
369 aa  334  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0115  peptidase M29 aminopeptidase II  49.58 
 
 
357 aa  334  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0911  aminopeptidase protein  45.65 
 
 
369 aa  332  6e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0175579  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0795  peptidase M29, aminopeptidase II  44.74 
 
 
389 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2644  peptidase M29, aminopeptidase II  46.34 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2712  peptidase M29 aminopeptidase II  44.99 
 
 
366 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1076  peptidase M29 aminopeptidase II  49.15 
 
 
352 aa  316  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0109  peptidase M29 aminopeptidase II  48.88 
 
 
357 aa  313  4.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00036007  normal  0.110934 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1401  peptidase M29 aminopeptidase II  44.66 
 
 
367 aa  310  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1489  peptidase M29, aminopeptidase II  50.85 
 
 
370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.364607  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0868  metalloprotease  42.62 
 
 
375 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0549814  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0855  metalloprotease  42.62 
 
 
375 aa  298  8e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1909  peptidase M29, aminopeptidase II  39.13 
 
 
368 aa  290  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.216085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1594  peptidase M29, aminopeptidase II  38.59 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000189753  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2973  peptidase M29 aminopeptidase II  38.46 
 
 
367 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000872397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1311  peptidase M29 aminopeptidase II  38.19 
 
 
367 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000144193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2642  peptidase M29 aminopeptidase II  36.96 
 
 
366 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2115  peptidase M29, aminopeptidase II  39.29 
 
 
367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.517106  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1842  peptidase M29 aminopeptidase II  36.78 
 
 
366 aa  249  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0278  peptidase M29 aminopeptidase II  39.29 
 
 
367 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2014  peptidase M29 aminopeptidase II  39.56 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1834  peptidase M29 aminopeptidase II  41.58 
 
 
366 aa  243  5e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0741  peptidase M29 aminopeptidase II  41.42 
 
 
363 aa  240  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2255  peptidase M29 aminopeptidase II  40.38 
 
 
388 aa  240  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1777  peptidase M29 aminopeptidase II  38.79 
 
 
380 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  37.57 
 
 
365 aa  237  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1544  peptidase M29 aminopeptidase II  35.52 
 
 
371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0257  peptidase M29 aminopeptidase II  40.82 
 
 
359 aa  234  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0129156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4820  aminopeptidase, putative  34.59 
 
 
371 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4414  aminopeptidase  34.59 
 
 
371 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4815  putative aminopeptidase  34.59 
 
 
371 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0443  putative aminopeptidase  34.32 
 
 
371 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4799  putative aminopeptidase  34.59 
 
 
371 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4579  aminopeptidase  34.59 
 
 
371 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4933  aminopeptidase  34.59 
 
 
371 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4795  putative aminopeptidase  34.32 
 
 
371 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4511  peptidase M29 aminopeptidase II  34.05 
 
 
371 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4432  aminopeptidase  34.32 
 
 
371 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0432  peptidase M29 aminopeptidase II  38.15 
 
 
360 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3346  peptidase M29 aminopeptidase II  34.22 
 
 
371 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.736707  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2666  peptidase M29 aminopeptidase II  37.97 
 
 
373 aa  226  8e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3214  putative aminopeptidase  32.97 
 
 
371 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2842  aminopeptidase  33.33 
 
 
374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.180088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3459  putative aminopeptidase  34.85 
 
 
371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0624241  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3636  peptidase M29 aminopeptidase II  31.89 
 
 
371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1280  aminopeptidase  37.87 
 
 
369 aa  219  7.999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3002  peptidase M29 aminopeptidase II  33.43 
 
 
374 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0261294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2391  putative aminopeptidase  32.52 
 
 
370 aa  209  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.982861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3265  peptidase M29, aminopeptidase II  37.59 
 
 
304 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139393  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3312  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like  37.86 
 
 
371 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.390308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1618  peptidase M29 aminopeptidase II  30.92 
 
 
405 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0907783  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2984  peptidase M29 aminopeptidase II  29.1 
 
 
413 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0276  peptidase M29 aminopeptidase II  30.79 
 
 
406 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2065  peptidase M29 aminopeptidase II  27.61 
 
 
413 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.610998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2795  peptidase M29 aminopeptidase II  31.03 
 
 
399 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1192  peptidase M29 aminopeptidase II  26.7 
 
 
399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.318194 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2212  peptidase M29, aminopeptidase II  30.95 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2013  peptidase M29 aminopeptidase II  28.21 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0975831  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0240  peptidase M29, aminopeptidase II  31.05 
 
 
416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3212  aminopeptidase T  27.21 
 
 
418 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2758  M29 family peptidase  27.57 
 
 
403 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3021  aminopeptidase T  30.88 
 
 
418 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1832  peptidase M29 aminopeptidase II  28.89 
 
 
411 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7164  peptidase M29, aminopeptidase II  28.74 
 
 
418 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3504  peptidase M29 aminopeptidase II  27.74 
 
 
418 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0309  peptidase M29 aminopeptidase II  28.5 
 
 
409 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0359  aminopeptidase AmpS  28.26 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0297  aminopeptidase; peptidase_M29  28.5 
 
 
409 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0403  aminopeptidase AmpS  28.26 
 
 
409 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0594317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0361  aminopeptidase AmpS  28.5 
 
 
409 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0301  aminopeptidase; peptidase_M29  28.26 
 
 
409 aa  119  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0314  aminopeptidase AmpS  28.26 
 
 
409 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0763  peptidase M29 aminopeptidase II  28.06 
 
 
417 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0329  aminopeptidase AmpS  28.01 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1510  peptidase M29 aminopeptidase II  28.29 
 
 
409 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.415372  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2586  peptidase M29, aminopeptidase II  28.33 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.424521  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0908  peptidase M29, aminopeptidase II  28.57 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.941281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0078  peptidase M29 aminopeptidase II  28.92 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0071  peptidase M29, aminopeptidase II  29.66 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2253  aminopeptidase  25.62 
 
 
411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.06051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0376  aminopeptidase AmpS  27.52 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4944  aminopeptidase AmpS  27.52 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1965  aminopeptidase  25.06 
 
 
411 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0308  peptidase M29 aminopeptidase II  27.27 
 
 
409 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2184  peptidase M29, aminopeptidase II  28.81 
 
 
423 aa  112  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3670  peptidase M29 aminopeptidase II  29.18 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0622  peptidase M29 aminopeptidase II  28.74 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1971  peptidase M29 aminopeptidase II  28.86 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.0591369 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3780  peptidase M29 aminopeptidase II  28.64 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2902  peptidase M29 aminopeptidase II  26.17 
 
 
409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00020205  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0137  aminopeptidase  28.75 
 
 
416 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4551  peptidase M29 aminopeptidase II  27.78 
 
 
417 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.123351  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3472  peptidase M29 aminopeptidase II  28.39 
 
 
419 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.748808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5326  peptidase M29 aminopeptidase II  29.79 
 
 
399 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4287  peptidase M29 aminopeptidase II  27.05 
 
 
417 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.696166 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1933  peptidase M29, aminopeptidase II  25.98 
 
 
415 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1967  peptidase M29 aminopeptidase II  25.98 
 
 
415 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>