More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84563 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_84563  asparaginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
511 aa  1066    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.600288  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3170  asparaginyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2948  asparaginyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3630  asparaginyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
463 aa  326  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.256869 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0101  asparaginyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
462 aa  325  1e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3649  asparaginyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
463 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0830  asparaginyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
462 aa  322  7e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0583  asparaginyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
481 aa  320  5e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4390  asparaginyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
463 aa  319  6e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2246  asparaginyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
463 aa  317  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2574  asparaginyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
464 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000372137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0569  asparaginyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
463 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00666077  normal  0.0252712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3176  asparaginyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.534078 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1198  asparaginyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
462 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.268434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4292  asparaginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003150  asparaginyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
472 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000140895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4454  asparaginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
463 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4302  asparaginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
463 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.678889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4802  asparaginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
463 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4673  asparaginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
463 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0858100000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4670  asparaginyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.135639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4685  asparaginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
463 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.765592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4685  asparaginyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
463 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000178591  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3921  asparaginyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
467 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0095  asparaginyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
472 aa  312  9e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113003  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01897  asparaginyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
472 aa  312  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0099  asparaginyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
461 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0915  asparaginyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
481 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00479655  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1719  asparaginyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
463 aa  311  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00602659  normal  0.38448 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2208  asparaginyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
467 aa  310  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0689  asparaginyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
456 aa  310  5e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.881016 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03073  asparaginyl-tRNA synthetase Slm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09630)  36.18 
 
 
537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.216397 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2236  asparaginyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1329  asparaginyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08140  asparaginyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
463 aa  307  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00934  asparaginyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
466 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000319087  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2713  asparaginyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
466 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2190  asparaginyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
466 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0049494  normal  0.657641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2666  asparaginyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
466 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000363068  normal  0.0518169 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00941  hypothetical protein  37.35 
 
 
466 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000272828  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1030  asparaginyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
466 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00035335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1038  asparaginyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
466 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1091  asparaginyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000126096  normal  0.367452 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2388  asparaginyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
466 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00156361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2483  asparaginyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
462 aa  305  9.000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0370887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3247  asparaginyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0070  asparaginyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04580  asparaginyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
467 aa  305  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000141691  unclonable  0.00000000215103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2654  asparaginyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
463 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0440148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0586  asparaginyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 
468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1004  asparaginyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
479 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1638  asparaginyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00663553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1684  asparaginyl-tRNA synthetase  34.64 
 
 
466 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000115378  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1731  asparaginyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 
466 aa  302  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00203344  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3378  asparaginyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 
461 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4851  asparaginyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 
463 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3724  asparaginyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
462 aa  300  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28968  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0882  asparaginyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
461 aa  299  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0374  asparaginyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
476 aa  299  9e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.551961  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4215  asparaginyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
479 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.37177  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1667  asparaginyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
466 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000224533  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1008  asparaginyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
466 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000354576  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2648  asparaginyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
466 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000725145  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1980  asparaginyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
466 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000244559  normal  0.95853 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1035  asparaginyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
466 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.00196064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2558  asparaginyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
466 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1100  asparaginyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
466 aa  297  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298857  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2442  asparaginyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
479 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0431  asparaginyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
460 aa  297  4e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51201  predicted protein  36 
 
 
503 aa  296  5e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.037074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3019  asparaginyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
482 aa  296  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.852561  hitchhiker  0.00877585 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1156  asparaginyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
461 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2591  asparaginyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
466 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2057  asparaginyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
466 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1785  asparaginyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
466 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00203512  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3465  asparaginyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
475 aa  295  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2475  asparaginyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
466 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1067  asparaginyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
466 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  hitchhiker  0.000331751 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0824  asparaginyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 
454 aa  295  2e-78  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1117  asparaginyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
466 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105371  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0001  asparaginyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
461 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2958  asparaginyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
461 aa  293  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000035499  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0408  asparaginyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 
467 aa  292  8e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0370  asparaginyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
467 aa  292  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02652  asparaginyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
465 aa  292  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_42247  predicted protein  35.66 
 
 
467 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0980  asparaginyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 
473 aa  291  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000864605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0096  asparaginyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
445 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2218  asparaginyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2034  asparaginyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000113137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00748  asparaginyl-tRNA synthetase  33.82 
 
 
464 aa  290  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.430236  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2223  asparaginyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 
466 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000670625  hitchhiker  0.00213208 
 
 
-
 
NC_002950  PG1121  asparaginyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
469 aa  288  1e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1947  asparaginyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
466 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000128723  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2306  asparaginyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
466 aa  289  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000186406  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2592  asparaginyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
464 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.258167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1940  asparaginyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
466 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1879  asparaginyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 
465 aa  288  2e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2273  asparaginyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
454 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.112363  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2087  asparaginyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
471 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>