16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32086 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32086  predicted protein  100 
 
 		 1328 aa  2686    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0401498 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33302  predicted protein  90.58 
 
 		 769 aa  1168    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91563  RNA-directed DNA polymerase Tps5.3 polyprotein  90.36 
 
 		 1040 aa  1687    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33305  retrotransposon  99.44 
 
 		 182 aa  362  2e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000145871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30978  predicted protein  95.15 
 
 		 206 aa  279  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628694  normal  0.245706 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30979  predicted protein  77.42 
 
 		 189 aa  275  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.742506  normal  0.5687 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_14352  predicted protein  89.66 
 
 		 193 aa  237  9e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30986  RNA-directed DNA polymerase  29.62 
 
 		 670 aa  203  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.663628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33721  predicted protein  65.6 
 
 		 187 aa  143  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04289  conserved hypothetical protein  26.56 
 
 		 1460 aa  117  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000615608  unclonable  4.33827e-18 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05227  conserved hypothetical protein  24.25 
 
 		 886 aa  97.8  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.126983  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02635  hypothetical protein  28.12 
 
 		 221 aa  55.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.432273  normal  0.283928 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_38979  predicted protein  28.86 
 
 		 1165 aa  55.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39223  predicted protein  28.19 
 
 		 1161 aa  53.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.2 
 
 		 2313 aa  52.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  46.3 
 
 		 329 aa  47.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>