15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33302 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32086  predicted protein  89.93 
 
 		 1328 aa  1162    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0401498 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33302  predicted protein  100 
 
 		 769 aa  1535    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91563  RNA-directed DNA polymerase Tps5.3 polyprotein  84.91 
 
 		 1040 aa  1060    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30978  predicted protein  82.84 
 
 		 206 aa  202  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628694  normal  0.245706 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_14352  predicted protein  84.91 
 
 		 193 aa  200  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33721  predicted protein  65.52 
 
 		 187 aa  138  4e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30986  RNA-directed DNA polymerase  35.09 
 
 		 670 aa  83.6  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.663628  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04289  conserved hypothetical protein  26.84 
 
 		 1460 aa  83.2  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000615608  unclonable  4.33827e-18 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05227  conserved hypothetical protein  26.06 
 
 		 886 aa  80.1  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.126983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.79 
 
 		 2449 aa  53.9  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_38979  predicted protein  30.83 
 
 		 1165 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02635  hypothetical protein  27.34 
 
 		 221 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.432273  normal  0.283928 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39223  predicted protein  30.08 
 
 		 1161 aa  52  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31875  predicted protein  30.08 
 
 		 1289 aa  51.2  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  35.48 
 
 		 489 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>