13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30986 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30986  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 670 aa  1387    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.663628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31542  predicted protein  99.3 
 
 		 205 aa  283  9e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.292971 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32086  predicted protein  28.77 
 
 		 1328 aa  199  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0401498 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91563  RNA-directed DNA polymerase Tps5.3 polyprotein  38.31 
 
 		 1040 aa  142  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33302  predicted protein  35.09 
 
 		 769 aa  83.2  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30979  predicted protein  28.49 
 
 		 189 aa  66.2  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.742506  normal  0.5687 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28862  ATP-dependent RNA helicase  27.59 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.535981  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00970  gag-pol polyprotein, putative  29.12 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456464  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05780  gag-pol polyprotein, putative  31.3 
 
 		 428 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0862484  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28859  predicted protein  30.39 
 
 		 110 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.121291  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04289  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 1460 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000615608  unclonable  4.33827e-18 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30978  predicted protein  27.54 
 
 		 206 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628694  normal  0.245706 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33305  retrotransposon  26.54 
 
 		 182 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000145871  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>