16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_91563 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32086  predicted protein  90.36 
 
 		 1328 aa  1634    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0401498 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33302  predicted protein  84.77 
 
 		 769 aa  1035    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91563  RNA-directed DNA polymerase Tps5.3 polyprotein  100 
 
 		 1040 aa  2080    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30978  predicted protein  93.33 
 
 		 206 aa  279  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628694  normal  0.245706 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_14352  predicted protein  68.36 
 
 		 193 aa  152  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30986  RNA-directed DNA polymerase  38.31 
 
 		 670 aa  142  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.663628  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04289  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 		 1460 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000615608  unclonable  4.33827e-18 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33721  predicted protein  49.6 
 
 		 187 aa  96.3  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05227  conserved hypothetical protein  24.25 
 
 		 886 aa  94.4  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.126983  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02635  hypothetical protein  28.12 
 
 		 221 aa  55.8  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.432273  normal  0.283928 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_38979  predicted protein  28.86 
 
 		 1165 aa  55.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39223  predicted protein  28.19 
 
 		 1161 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31875  predicted protein  28.19 
 
 		 1289 aa  53.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35923  predicted protein  28.19 
 
 		 1289 aa  52.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.584547  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39076  predicted protein  28.19 
 
 		 1175 aa  52.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37226  predicted protein  27.7 
 
 		 1165 aa  49.7  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>