46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9890 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_9890  predicted protein  100 
 
 
282 aa  584  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.474356  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12577  predicted protein  30.07 
 
 
294 aa  143  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_3834  predicted protein  35.63 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3843  predicted protein  30 
 
 
329 aa  139  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4795  predicted protein  31.97 
 
 
303 aa  129  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260094  normal  0.0228306 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29690  predicted protein  28.03 
 
 
384 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0387408  hitchhiker  0.00114029 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27219  predicted protein  28.03 
 
 
384 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293402  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12510  predicted protein  30.43 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01358  type 2C protein phosphatase (Eurofung)  30.18 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12641  predicted protein  30.61 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40915  predicted protein  33.04 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400149  normal  0.389571 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12786  predicted protein  34.52 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0003096  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51117  predicted protein  27.94 
 
 
685 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0207292 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85643  predicted protein  26.54 
 
 
493 aa  73.2  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.520141 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06892  type 2C protein phosphatase (PP2C) (Eurofung)  29.78 
 
 
566 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.594549 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16113  predicted protein  30.09 
 
 
344 aa  68.9  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000261372  normal  0.0104498 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44850  predicted protein  29.17 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00914  protein phosphatase 2C, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15800)  30.06 
 
 
560 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204416  normal  0.169462 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13365  predicted protein  27.91 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.343984  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50148  predicted protein  23.51 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48157  predicted protein  34.85 
 
 
491 aa  66.2  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46158  predicted protein  28.24 
 
 
442 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15442  predicted protein  28.87 
 
 
320 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.374929  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46023  predicted protein  25.63 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0238096 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49552  predicted protein  26.11 
 
 
329 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00203514  hitchhiker  0.0020106 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33639  predicted protein  28.48 
 
 
392 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.214309 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48490  predicted protein  28.37 
 
 
409 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04830  Ptc1p, putative  30 
 
 
487 aa  61.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.461254  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00360  protein phosphatase type 2C, putative  23.18 
 
 
552 aa  60.1  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57623  predicted protein  24.39 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229552  decreased coverage  0.00611536 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46160  predicted protein  25.33 
 
 
484 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0551797  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36779  predicted protein  24.7 
 
 
338 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.598787  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  22.49 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.69 
 
 
611 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31973  predicted protein  22.9 
 
 
654 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02472  protein phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13740)  31.18 
 
 
326 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130584  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05722  protein phophatase 2C family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06860)  27.89 
 
 
596 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45230  predicted protein  24.76 
 
 
646 aa  53.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9157  predicted protein  28.48 
 
 
299 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56574  predicted protein  30 
 
 
363 aa  52.8  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225728  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  25.77 
 
 
597 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36975  predicted protein  23.99 
 
 
593 aa  52.4  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.113846 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119508  protein phosphatase 2C-like protein  25.11 
 
 
388 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865792  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44306  predicted protein  25.08 
 
 
865 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.677805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  24.31 
 
 
548 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01430  conserved hypothetical protein  27.08 
 
 
428 aa  43.9  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>