19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50148 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_50148  predicted protein  100 
 
 
377 aa  774    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46160  predicted protein  24.33 
 
 
484 aa  70.5  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0551797  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46158  predicted protein  24.48 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9890  predicted protein  23.51 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.474356  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4795  predicted protein  26.41 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260094  normal  0.0228306 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48490  predicted protein  22.85 
 
 
409 aa  63.2  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3843  predicted protein  25.86 
 
 
329 aa  60.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_3834  predicted protein  22.38 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27219  predicted protein  25.54 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293402  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29690  predicted protein  25.54 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0387408  hitchhiker  0.00114029 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12577  predicted protein  24.93 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44850  predicted protein  24.82 
 
 
289 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51117  predicted protein  26.07 
 
 
685 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0207292 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46023  predicted protein  25.7 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0238096 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01358  type 2C protein phosphatase (Eurofung)  28.86 
 
 
420 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40915  predicted protein  26.51 
 
 
318 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400149  normal  0.389571 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15442  predicted protein  25.98 
 
 
320 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.374929  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9157  predicted protein  28.04 
 
 
299 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49552  predicted protein  24.85 
 
 
329 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00203514  hitchhiker  0.0020106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>