32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3843 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_3843  predicted protein  100 
 
 
329 aa  684    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12577  predicted protein  50.31 
 
 
294 aa  309  4e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4795  predicted protein  42.42 
 
 
303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260094  normal  0.0228306 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29690  predicted protein  31.56 
 
 
384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0387408  hitchhiker  0.00114029 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27219  predicted protein  31.56 
 
 
384 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293402  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9890  predicted protein  30 
 
 
282 aa  139  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.474356  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_3834  predicted protein  27.69 
 
 
252 aa  92  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01358  type 2C protein phosphatase (Eurofung)  28.63 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00360  protein phosphatase type 2C, putative  27.92 
 
 
552 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45230  predicted protein  24.49 
 
 
646 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00914  protein phosphatase 2C, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15800)  29.57 
 
 
560 aa  63.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204416  normal  0.169462 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49552  predicted protein  24.25 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00203514  hitchhiker  0.0020106 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16113  predicted protein  25.5 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000261372  normal  0.0104498 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50148  predicted protein  25.86 
 
 
377 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85643  predicted protein  24.81 
 
 
493 aa  58.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12510  predicted protein  23.64 
 
 
229 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12641  predicted protein  24.51 
 
 
249 aa  52.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51117  predicted protein  26.91 
 
 
685 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0207292 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01430  conserved hypothetical protein  22.83 
 
 
428 aa  50.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05722  protein phophatase 2C family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06860)  24.25 
 
 
596 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36975  predicted protein  24.16 
 
 
593 aa  49.3  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.113846 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36779  predicted protein  23.21 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.598787  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9157  predicted protein  24.23 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57623  predicted protein  22.53 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229552  decreased coverage  0.00611536 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15442  predicted protein  24.92 
 
 
320 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.374929  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40915  predicted protein  26.42 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400149  normal  0.389571 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46160  predicted protein  25.22 
 
 
484 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0551797  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12786  predicted protein  27.38 
 
 
175 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0003096  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46158  predicted protein  22.96 
 
 
442 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31973  predicted protein  24.23 
 
 
654 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06892  type 2C protein phosphatase (PP2C) (Eurofung)  31.87 
 
 
566 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.594549 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56574  predicted protein  20.07 
 
 
363 aa  42.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225728  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>