17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29690 on replicon NC_009375
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_27219  predicted protein  100 
 
 
384 aa  783    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293402  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29690  predicted protein  100 
 
 
384 aa  783    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0387408  hitchhiker  0.00114029 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4795  predicted protein  33.92 
 
 
303 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260094  normal  0.0228306 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12577  predicted protein  32.12 
 
 
294 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3843  predicted protein  31.56 
 
 
329 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9890  predicted protein  28.03 
 
 
282 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.474356  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_3834  predicted protein  29.76 
 
 
252 aa  89  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36975  predicted protein  24.57 
 
 
593 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.113846 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50148  predicted protein  25.54 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46158  predicted protein  24.75 
 
 
442 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05722  protein phophatase 2C family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06860)  26.11 
 
 
596 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46023  predicted protein  25.21 
 
 
369 aa  49.7  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0238096 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46160  predicted protein  24.92 
 
 
484 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0551797  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36779  predicted protein  20.86 
 
 
338 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.598787  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51117  predicted protein  28.43 
 
 
685 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0207292 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48490  predicted protein  24.49 
 
 
409 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13696  predicted protein  32.43 
 
 
355 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0127334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>