36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46158 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46158  predicted protein  100 
 
 
442 aa  907    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46160  predicted protein  28.66 
 
 
484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0551797  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48490  predicted protein  28.37 
 
 
409 aa  100  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_3834  predicted protein  29.59 
 
 
252 aa  82.8  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01358  type 2C protein phosphatase (Eurofung)  30.53 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50148  predicted protein  24.48 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45230  predicted protein  28.25 
 
 
646 aa  67.4  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727498  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33639  predicted protein  29.56 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.214309 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9890  predicted protein  28.24 
 
 
282 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.474356  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16113  predicted protein  31.53 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000261372  normal  0.0104498 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12510  predicted protein  30.62 
 
 
229 aa  63.9  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85643  predicted protein  28.31 
 
 
493 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.520141 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00360  protein phosphatase type 2C, putative  27.46 
 
 
552 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49552  predicted protein  30.18 
 
 
329 aa  60.1  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00203514  hitchhiker  0.0020106 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44850  predicted protein  28.31 
 
 
289 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12577  predicted protein  24.1 
 
 
294 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12641  predicted protein  34.72 
 
 
249 aa  57  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40915  predicted protein  31.51 
 
 
318 aa  57  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400149  normal  0.389571 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12786  predicted protein  36.11 
 
 
175 aa  56.6  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0003096  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29690  predicted protein  24.75 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0387408  hitchhiker  0.00114029 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27219  predicted protein  24.75 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.293402  normal  0.383918 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4795  predicted protein  26.39 
 
 
303 aa  54.3  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260094  normal  0.0228306 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48157  predicted protein  29.05 
 
 
491 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02472  protein phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13740)  29.73 
 
 
326 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130584  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31973  predicted protein  24.21 
 
 
654 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15442  predicted protein  35.57 
 
 
320 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.374929  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57623  predicted protein  30.21 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.229552  decreased coverage  0.00611536 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36779  predicted protein  25.56 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.598787  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04830  Ptc1p, putative  30.06 
 
 
487 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.461254  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13696  predicted protein  25.28 
 
 
355 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0127334  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56574  predicted protein  30.65 
 
 
363 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.225728  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13365  predicted protein  30.61 
 
 
297 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.343984  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119508  protein phosphatase 2C-like protein  23.27 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865792  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3843  predicted protein  22.96 
 
 
329 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  26.39 
 
 
241 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9157  predicted protein  30.06 
 
 
299 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>