35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47117 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_47117  predicted protein  100 
 
 
743 aa  1544    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47110  predicted protein  32.1 
 
 
907 aa  353  5.9999999999999994e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847586  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42721  predicted protein  33.17 
 
 
773 aa  213  7e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47112  predicted protein  34.35 
 
 
540 aa  204  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0949637  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42547  predicted protein  34.06 
 
 
788 aa  203  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290154  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26056  predicted protein  33.12 
 
 
717 aa  80.5  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.100829  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2901  hypothetical protein  28.85 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000400572  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43796  predicted protein  30.05 
 
 
371 aa  69.7  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0687  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  31.17 
 
 
221 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.783557  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0658  hypothetical protein  34.75 
 
 
519 aa  66.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  0.0369536 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72561  predicted protein  22.49 
 
 
402 aa  63.9  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.120093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4383  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  24.77 
 
 
286 aa  63.2  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0822765  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2614  hypothetical protein  27.95 
 
 
262 aa  62  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28420  hypothetical protein  32.8 
 
 
296 aa  61.2  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25794  predicted protein  30 
 
 
292 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0326  glycosyl transferase  28.76 
 
 
269 aa  59.3  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00360  conserved hypothetical protein  29.84 
 
 
540 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3933  hypothetical protein  29.01 
 
 
279 aa  55.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07534  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14040)  26.24 
 
 
379 aa  54.3  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414681  normal  0.201966 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2550  glycosyl transferase  28.37 
 
 
327 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39480  predicted protein  23.01 
 
 
408 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01430  alpha-1,6-mannosyltransferase, putative  26.83 
 
 
330 aa  52  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76016  membrane-bound alpha-1,6- mannosyltransferase Initiation-specific  23.97 
 
 
377 aa  51.6  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07230  alpha-1,6-mannosyltransferase, putative  37.5 
 
 
572 aa  50.8  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0657  hypothetical protein  28.1 
 
 
535 aa  50.8  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.86756  normal  0.15093 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45039  predicted protein  24.78 
 
 
354 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3661  hypothetical protein  23.95 
 
 
294 aa  50.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00529  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  49.3  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.800515  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04716  alpha-1,6-mannosyltransferase subunit (Och1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08580)  25.57 
 
 
362 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314566  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02626  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02040)  23.57 
 
 
416 aa  48.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01620  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02040)  22.33 
 
 
387 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17412 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83423  predicted protein  27.89 
 
 
405 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.582312  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11000  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 
383 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467183  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06534  MIPC synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7ZA39]  28.03 
 
 
355 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1167  polysaccharide biosynthesis protein CpsM(V)  28.15 
 
 
241 aa  44.3  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.10639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>