13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45039 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45039  predicted protein  100 
 
 
354 aa  743    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39480  predicted protein  44.32 
 
 
408 aa  290  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43796  predicted protein  38.75 
 
 
371 aa  196  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0326  glycosyl transferase  33.33 
 
 
269 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47110  predicted protein  27.51 
 
 
907 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847586  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2614  hypothetical protein  29.41 
 
 
262 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42721  predicted protein  27.11 
 
 
773 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47117  predicted protein  24.78 
 
 
743 aa  49.3  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76016  membrane-bound alpha-1,6- mannosyltransferase Initiation-specific  22.88 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0687  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  28.57 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.783557  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26056  predicted protein  25 
 
 
717 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.100829  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02626  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02040)  24.78 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42547  predicted protein  26.9 
 
 
788 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>