14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0326 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0326  glycosyl transferase  100 
 
 
269 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2614  hypothetical protein  58.59 
 
 
262 aa  314  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0687  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  36.08 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.783557  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47117  predicted protein  28.76 
 
 
743 aa  59.3  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2901  hypothetical protein  26.53 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000400572  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45039  predicted protein  33.33 
 
 
354 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39480  predicted protein  32.2 
 
 
408 aa  55.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4383  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  26.63 
 
 
286 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0822765  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47110  predicted protein  34.41 
 
 
907 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847586  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26056  predicted protein  23.5 
 
 
717 aa  46.2  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.100829  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42721  predicted protein  21.05 
 
 
773 aa  45.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42547  predicted protein  24.75 
 
 
788 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290154  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25794  predicted protein  24.42 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0270  mannosyltransferase OCH1-related enzyme  24.87 
 
 
343 aa  42.7  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>