10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39480 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_39480  predicted protein  100 
 
 
408 aa  850    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45039  predicted protein  44.32 
 
 
354 aa  290  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43796  predicted protein  35.58 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0326  glycosyl transferase  32.2 
 
 
269 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47110  predicted protein  25.54 
 
 
907 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847586  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47117  predicted protein  23.01 
 
 
743 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26056  predicted protein  32.22 
 
 
717 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.100829  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2614  hypothetical protein  29.27 
 
 
262 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42547  predicted protein  26.8 
 
 
788 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290154  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42721  predicted protein  22.89 
 
 
773 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>