15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_43796 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_43796  predicted protein  100 
 
 
371 aa  773    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45039  predicted protein  38.75 
 
 
354 aa  196  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39480  predicted protein  35.58 
 
 
408 aa  175  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42721  predicted protein  29.41 
 
 
773 aa  77  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42547  predicted protein  27 
 
 
788 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290154  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47117  predicted protein  30.05 
 
 
743 aa  69.7  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47110  predicted protein  33.77 
 
 
907 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847586  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26056  predicted protein  35.9 
 
 
717 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.100829  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2901  hypothetical protein  25.35 
 
 
292 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000400572  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0687  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  26.83 
 
 
221 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.783557  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2614  hypothetical protein  29.7 
 
 
262 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11000  conserved hypothetical protein  30.71 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467183  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83423  predicted protein  28.73 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.582312  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76016  membrane-bound alpha-1,6- mannosyltransferase Initiation-specific  35.62 
 
 
377 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08986  conserved hypothetical protein  35.94 
 
 
417 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>