31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42547 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42547  predicted protein  100 
 
 
788 aa  1644    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290154  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42721  predicted protein  38.64 
 
 
773 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47110  predicted protein  35.15 
 
 
907 aa  226  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847586  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47117  predicted protein  34.06 
 
 
743 aa  203  9e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47112  predicted protein  24.86 
 
 
540 aa  116  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0949637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0687  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  27.52 
 
 
221 aa  85.9  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.783557  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2901  hypothetical protein  30.45 
 
 
292 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000400572  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0658  hypothetical protein  39.32 
 
 
519 aa  76.6  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  0.0369536 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43796  predicted protein  27 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2614  hypothetical protein  30.96 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26056  predicted protein  26.82 
 
 
717 aa  70.5  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.100829  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4383  glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif  27.81 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0822765  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28420  hypothetical protein  27.67 
 
 
296 aa  67  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25794  predicted protein  27.67 
 
 
292 aa  66.6  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0657  hypothetical protein  31.97 
 
 
535 aa  63.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.86756  normal  0.15093 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72561  predicted protein  27.27 
 
 
402 aa  61.6  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.120093 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76016  membrane-bound alpha-1,6- mannosyltransferase Initiation-specific  22.56 
 
 
377 aa  61.6  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00360  conserved hypothetical protein  24.52 
 
 
540 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11000  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 
383 aa  57.8  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467183  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00529  hypothetical protein  28.95 
 
 
210 aa  52.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.800515  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01620  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02040)  27.08 
 
 
387 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17412 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04716  alpha-1,6-mannosyltransferase subunit (Och1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08580)  33.64 
 
 
362 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.314566  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02626  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02040)  32.29 
 
 
416 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01430  alpha-1,6-mannosyltransferase, putative  22.81 
 
 
330 aa  48.5  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39480  predicted protein  26.8 
 
 
408 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83423  predicted protein  24.86 
 
 
405 aa  47.8  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.582312  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46335  predicted protein  26.72 
 
 
490 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00257866  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07230  alpha-1,6-mannosyltransferase, putative  31.15 
 
 
572 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06534  MIPC synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7ZA39]  25.87 
 
 
355 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3661  hypothetical protein  25.38 
 
 
294 aa  45.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0326  glycosyl transferase  24.75 
 
 
269 aa  44.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>