33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1509 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  100 
 
 		 222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407353 
 
 
-
 
NC_002950  PG1511  hypothetical protein  82.69 
 
 		 53 aa  90.5  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000344371 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0765  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.33 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.58 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  29.63 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  28.7 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  29.63 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  28.75 
 
 		 238 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  27.83 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  28.07 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  28.75 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.89 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  22.52 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  28.75 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  28.7 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  27.93 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0589  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.7 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  32.1 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  25.93 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  25.93 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  25.93 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  25.93 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  25.93 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  27.71 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  23.53 
 
 		 225 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  28.75 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.21 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  28.07 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  27.5 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  22.28 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  24.07 
 
 		 238 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  29.41 
 
 		 224 aa  42  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  19.91 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>