25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4124 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4124  HNH nuclease  100 
 
 		 181 aa  380  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000599297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  38.46 
 
 		 122 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 92 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  40 
 
 		 101 aa  45.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  40 
 
 		 101 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11830  restriction endonuclease  41.82 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  46.3 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.307886  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  35.9 
 
 		 427 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  40.3 
 
 		 104 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10581  HNH endonuclease:HNH nuclease  44.44 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  27.47 
 
 		 443 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1138  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0987  HNH nuclease  46.3 
 
 		 113 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.565231  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  38.46 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 105 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 169 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  41.27 
 
 		 101 aa  41.6  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  39.58 
 
 		 427 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2175  hypothetical protein  35.38 
 
 		 124 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666285  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  38.71 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  28.95 
 
 		 221 aa  40.8  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>