18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72060 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_72060  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.250174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6258  hypothetical protein  66.67 
 
 		 63 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71900  hypothetical protein  41.67 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6236  hypothetical protein  41.67 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1928  translation initiation factor IF-2  38.81 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.430047  normal  0.032744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4435  hypothetical protein  41.3 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0153  hypothetical protein  48.89 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0171  hypothetical protein  48.89 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5074  hypothetical protein  48.89 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0169  hypothetical protein  48.89 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4434  hypothetical protein  39.13 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5466  hypothetical protein  51.28 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7136  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0678933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5020  hypothetical protein  51.28 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.403747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3736  hypothetical protein  42.86 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0110  hypothetical protein  43.48 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2134  hypothetical protein  40 
 
 		 74 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0234086  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0280  protein of unknown function DUF1127  37.5 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>