19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2134 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2134  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0234086  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27290  hypothetical protein  54.55 
 
 		 77 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3623  hypothetical protein  56 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0092253  normal  0.259405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2310  hypothetical protein  52.63 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1771  hypothetical protein  52.63 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1474  hypothetical protein  73.33 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3992  hypothetical protein  46.05 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00918844  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1439  hypothetical protein  73.33 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3850  hypothetical protein  71.11 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130823  normal  0.0670669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1864  hypothetical protein  66.67 
 
 		 50 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2330  hypothetical protein  46 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0344135  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0280  protein of unknown function DUF1127  55.26 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192126  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4435  hypothetical protein  44.44 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2778  hypothetical protein  48.15 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72060  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.250174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1648  hypothetical protein  42 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3736  hypothetical protein  47.62 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0019  hypothetical protein  42 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1229  hypothetical protein  42.22 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.288356  normal  0.563347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>