23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3736 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3736  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7136  hypothetical protein  43.28 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0678933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0280  protein of unknown function DUF1127  56.41 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192126  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0153  hypothetical protein  42.37 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5074  hypothetical protein  44.07 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5326  hypothetical protein  48.98 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0171  hypothetical protein  42.37 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0169  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5466  hypothetical protein  40.68 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5274  hypothetical protein  51.11 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5184  hypothetical protein  51.11 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1648  hypothetical protein  44.9 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.500303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6236  hypothetical protein  40.98 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72060  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.250174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71900  hypothetical protein  40.98 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0196  hypothetical protein  39.39 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.360735  hitchhiker  0.00059571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0019  hypothetical protein  44.9 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4435  hypothetical protein  36.67 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6258  hypothetical protein  48.84 
 
 		 63 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2140  hypothetical protein  44.19 
 
 		 85 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.430685  normal  0.0329099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5020  hypothetical protein  38.98 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.403747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1931  hypothetical protein  39.22 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.671427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2134  hypothetical protein  47.62 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0234086  normal  0.262679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>