13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2330 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2330  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0344135  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0280  protein of unknown function DUF1127  61.84 
 
 
76 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3623  hypothetical protein  47.92 
 
 
77 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0092253  normal  0.259405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1771  hypothetical protein  45.83 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3992  hypothetical protein  53.33 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00918844  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1474  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573464  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2134  hypothetical protein  46 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0234086  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3850  hypothetical protein  47.37 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130823  normal  0.0670669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7136  hypothetical protein  44.68 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0678933  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2310  hypothetical protein  46 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1439  hypothetical protein  47.37 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.132775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1864  hypothetical protein  44.74 
 
 
50 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217058  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2140  hypothetical protein  53.85 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.430685  normal  0.0329099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>