18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0280 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0280  protein of unknown function DUF1127  100 
 
 		 76 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2330  hypothetical protein  61.84 
 
 		 75 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0344135  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7136  hypothetical protein  50.82 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0678933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1474  hypothetical protein  52.17 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.573464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3623  hypothetical protein  52.38 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0092253  normal  0.259405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3850  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130823  normal  0.0670669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1439  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3736  hypothetical protein  56.41 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3992  hypothetical protein  42.31 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00918844  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1864  hypothetical protein  55.26 
 
 		 50 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27290  hypothetical protein  45.28 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1771  hypothetical protein  42.55 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2134  hypothetical protein  55.26 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0234086  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2310  hypothetical protein  47.17 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1441  hypothetical protein  40.79 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71900  hypothetical protein  42 
 
 		 67 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6236  hypothetical protein  42 
 
 		 67 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72060  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.250174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>