15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_71900 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_71900  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6236  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0110  hypothetical protein  63.38 
 
 
71 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5466  hypothetical protein  60.56 
 
 
71 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0153  hypothetical protein  63.38 
 
 
71 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0171  hypothetical protein  63.38 
 
 
71 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.687389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0169  hypothetical protein  61.97 
 
 
71 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194199  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5074  hypothetical protein  61.97 
 
 
71 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5020  hypothetical protein  57.75 
 
 
71 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.403747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4434  hypothetical protein  61.97 
 
 
71 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4435  hypothetical protein  57.45 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72060  hypothetical protein  41.67 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.250174  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6258  hypothetical protein  48.72 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3736  hypothetical protein  40.98 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149261  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0280  protein of unknown function DUF1127  42 
 
 
76 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192126  n/a   
 
 
-
 
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