14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5020 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_5020  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.403747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5466  hypothetical protein  97.18 
 
 		 71 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0110  hypothetical protein  80.28 
 
 		 71 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5074  hypothetical protein  73.24 
 
 		 71 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0169  hypothetical protein  71.83 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0153  hypothetical protein  71.83 
 
 		 71 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0171  hypothetical protein  71.83 
 
 		 71 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4434  hypothetical protein  67.61 
 
 		 71 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71900  hypothetical protein  57.75 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6236  hypothetical protein  57.75 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4435  hypothetical protein  56.25 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72060  hypothetical protein  51.28 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.250174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6258  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3736  hypothetical protein  38.98 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>