14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0171 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0153  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0171  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0169  hypothetical protein  95.77 
 
 		 71 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5074  hypothetical protein  92.96 
 
 		 71 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0110  hypothetical protein  74.65 
 
 		 71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5466  hypothetical protein  73.24 
 
 		 71 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5020  hypothetical protein  71.83 
 
 		 71 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.403747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4434  hypothetical protein  66.2 
 
 		 71 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71900  hypothetical protein  63.38 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6236  hypothetical protein  63.38 
 
 		 67 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4435  hypothetical protein  64.1 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6258  hypothetical protein  53.49 
 
 		 63 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72060  hypothetical protein  48.89 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.250174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3736  hypothetical protein  42.37 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>