16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6258 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6258  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72060  hypothetical protein  66.67 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.250174  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0153  hypothetical protein  53.49 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0171  hypothetical protein  53.49 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.687389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0169  hypothetical protein  53.49 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194199  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5074  hypothetical protein  53.49 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71900  hypothetical protein  48.72 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4435  hypothetical protein  47.5 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6236  hypothetical protein  48.72 
 
 
67 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5466  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5020  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.403747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0110  hypothetical protein  47.62 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4434  hypothetical protein  46.15 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3736  hypothetical protein  48.84 
 
 
67 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149261  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7136  hypothetical protein  47.73 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0678933  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3623  hypothetical protein  40.35 
 
 
77 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0092253  normal  0.259405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>