13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4434 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4434  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5074  hypothetical protein  69.01 
 
 		 71 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0169  hypothetical protein  67.61 
 
 		 71 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0110  hypothetical protein  70.42 
 
 		 71 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5020  hypothetical protein  67.61 
 
 		 71 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.403747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0153  hypothetical protein  66.2 
 
 		 71 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5466  hypothetical protein  66.2 
 
 		 71 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0171  hypothetical protein  66.2 
 
 		 71 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687389 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71900  hypothetical protein  61.97 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6236  hypothetical protein  61.97 
 
 		 67 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4435  hypothetical protein  52.08 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72060  hypothetical protein  39.13 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.250174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6258  hypothetical protein  46.15 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>