13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0110 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0110  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5466  hypothetical protein  81.69 
 
 		 71 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5020  hypothetical protein  80.28 
 
 		 71 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.403747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5074  hypothetical protein  76.06 
 
 		 71 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0169  hypothetical protein  74.65 
 
 		 71 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0153  hypothetical protein  74.65 
 
 		 71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0171  hypothetical protein  74.65 
 
 		 71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4434  hypothetical protein  70.42 
 
 		 71 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71900  hypothetical protein  63.38 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6236  hypothetical protein  63.38 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4435  hypothetical protein  58.97 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6258  hypothetical protein  47.62 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72060  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.250174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>