16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4435 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4435  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  164  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71900  hypothetical protein  57.45 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6236  hypothetical protein  57.45 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5074  hypothetical protein  66.67 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5020  hypothetical protein  56.25 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.403747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0153  hypothetical protein  64.1 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0171  hypothetical protein  64.1 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0169  hypothetical protein  64.1 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5466  hypothetical protein  54.17 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4434  hypothetical protein  52.08 
 
 		 71 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0110  hypothetical protein  58.97 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72060  hypothetical protein  41.3 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.250174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6258  hypothetical protein  47.5 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2174  hypothetical protein  39.34 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2134  hypothetical protein  44.44 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0234086  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3736  hypothetical protein  36.67 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>