197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21000 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_21000  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  883    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 		 769 aa  255  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4452  alcohol acetyltransferase  23.8 
 
 		 447 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1443  Alcohol acetyltransferase  25.84 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3214  hypothetical protein  21.22 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128156  normal  0.655309 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6240  condensation domain-containing protein  30 
 
 		 492 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217969  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6242  condensation domain-containing protein  29.33 
 
 		 406 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0880  condensation domain-containing protein  28.12 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0198363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1444  condensation domain protein  24.67 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  32.76 
 
 		 2577 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  32.89 
 
 		 2189 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  33.56 
 
 		 1114 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  27.59 
 
 		 5654 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  27.83 
 
 		 1914 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5162  condensation domain protein  28.28 
 
 		 843 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1928  hypothetical protein  19.95 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.29 
 
 		 6403 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  34.44 
 
 		 7712 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  34.5 
 
 		 2155 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3898  condensation domain protein  35.04 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2571  hypothetical protein  21.8 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31.13 
 
 		 2156 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.33 
 
 		 6889 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  29.25 
 
 		 2333 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  33.77 
 
 		 5467 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  30.07 
 
 		 4332 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  30.38 
 
 		 3296 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1036  acyltransferase PapA5  25.47 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  31.01 
 
 		 2156 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5089  Aspartate racemase  27.76 
 
 		 856 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  28.21 
 
 		 2448 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  28.89 
 
 		 2614 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  27.97 
 
 		 3432 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5736  condensation domain-containing protein  24.23 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  30.46 
 
 		 2156 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  31.61 
 
 		 1369 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1749  amino acid adenylation domain protein  26.51 
 
 		 1199 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.82306  normal  0.0351239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0191  amino acid adenylation domain-containing protein  31.69 
 
 		 1071 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604981  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2425  hypothetical protein  22.34 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32 
 
 		 5953 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  24.92 
 
 		 2867 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  27.18 
 
 		 2174 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  30.56 
 
 		 4336 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1180  non-ribosomal peptide synthetase, putative  31.16 
 
 		 1732 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1624  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.16 
 
 		 1732 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0134366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0287  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.16 
 
 		 1732 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0997015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1943  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  31.16 
 
 		 1741 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0874  putative non-ribosomal peptide synthetase  31.16 
 
 		 1732 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  31.54 
 
 		 1129 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.57 
 
 		 1806 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  26.06 
 
 		 2054 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  29.8 
 
 		 4483 aa  54.3  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4624  aspartate racemase  27.13 
 
 		 856 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240393 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2088  pyoverdine synthetase D  31.29 
 
 		 1739 aa  54.3  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.393572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  29.75 
 
 		 3290 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  31.61 
 
 		 2187 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  25.52 
 
 		 3824 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  28.71 
 
 		 7785 aa  53.5  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  29.11 
 
 		 3287 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  25.52 
 
 		 2664 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.11 
 
 		 3297 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.11 
 
 		 3294 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  29.11 
 
 		 3290 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  29.11 
 
 		 3294 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  25.31 
 
 		 4531 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  26.64 
 
 		 3453 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  31.29 
 
 		 1829 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  27.38 
 
 		 4318 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  25.33 
 
 		 3018 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  27.45 
 
 		 4383 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  30.32 
 
 		 2419 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  28.48 
 
 		 9498 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2201  non-ribosomal peptide synthetase/polyketide synthase  29.02 
 
 		 2106 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  24.76 
 
 		 2033 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  31.65 
 
 		 5149 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  25.72 
 
 		 2573 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1928  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaI  30.43 
 
 		 1745 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361647  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  28.17 
 
 		 3230 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  31.65 
 
 		 1776 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4417  amino acid adenylation domain-containing protein  29.27 
 
 		 1104 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.543215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  31.65 
 
 		 4136 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  25.67 
 
 		 2883 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1971  amino acid adenylation domain-containing protein  27.88 
 
 		 1109 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.353817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  26.64 
 
 		 2606 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  28.99 
 
 		 4317 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  28.26 
 
 		 4317 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6557  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.67 
 
 		 2320 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000475071 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  28.47 
 
 		 3102 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  26.55 
 
 		 4960 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  30.12 
 
 		 5328 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  25.69 
 
 		 2201 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  26.28 
 
 		 3639 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  24.84 
 
 		 3498 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6489  condensation domain-containing protein  24.23 
 
 		 417 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  29.14 
 
 		 6661 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  26.76 
 
 		 3180 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  24.92 
 
 		 2350 aa  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  26.86 
 
 		 5372 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  29.61 
 
 		 4991 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  25 
 
 		 6676 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>