173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3636 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3636  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1982  hypothetical protein  41.23 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.963759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2460  protein of unknown function DUF34  37.6 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2502  hypothetical protein  39.02 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0876  hypothetical protein  36.65 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4129  hypothetical protein  35.46 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1302  hypothetical protein  34.66 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4434  hypothetical protein  35.06 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00125483  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0889  hypothetical protein  35.06 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5016  hypothetical protein  36.36 
 
 		 252 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0909  hypothetical protein  33.47 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.384195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4423  hypothetical protein  33.86 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.348854 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4547  hypothetical protein  33.86 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3588  putative hydrolase-oxidase  33.46 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1165  putative hydrolase-oxidase  33.46 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0336563  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1114  putative hydrolase-oxidase  33.46 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000203365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57740  hypothetical protein  35.57 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2248  hypothetical protein  34.01 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000952152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2693  hypothetical protein  32.53 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000722609  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2050  hypothetical protein  32.91 
 
 		 249 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000274471  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3106  protein of unknown function DUF34  34.62 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1572  hypothetical protein  33.87 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000308577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0007  protein of unknown function DUF34  33.33 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3111  putative hydrolase-oxidase  33.6 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2576  protein of unknown function DUF34  34.01 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.011272  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1271  hypothetical protein  33.08 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000360111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1114  hypothetical protein  33.86 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00602952  normal  0.0178129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0367  hypothetical protein  33.6 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.465671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0358  hypothetical protein  33.6 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.388987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2580  hypothetical protein  31.73 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  normal  0.0950239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2571  hypothetical protein  33.87 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2460  hypothetical protein  31.73 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000153632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2210  hypothetical protein  32.94 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2667  hypothetical protein  34.66 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0440  hypothetical protein  34.66 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0419  hypothetical protein  34.66 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1892  hypothetical protein  32.13 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.339977  hitchhiker  0.0000115783 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3538  hypothetical protein  34 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.416608 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1137  protein of unknown function DUF34  31.62 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.43804  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1728  hypothetical protein  31.73 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000970699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0023  hypothetical protein  31.27 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1225  putative hydrolase-oxidase  32.53 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2467  hypothetical protein  31.73 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004118  hypothetical protein  33.19 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1758  hypothetical protein  31.73 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000958056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1884  protein of unknown function DUF34  31.33 
 
 		 250 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000303025  hitchhiker  0.00204179 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0910  hypothetical protein  32.07 
 
 		 252 aa  128  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2699  hypothetical protein  34.14 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.736559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3370  hypothetical protein  33.98 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3677  hypothetical protein  34.14 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1653  hypothetical protein  31.73 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000959566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3255  NIF3 family protein  34.14 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1804  NIF3 family protein  34.14 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3651  NIF3 family protein  34.14 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3708  NIF3 family protein  34.14 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2749  NIF3 family protein  34.14 
 
 		 248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2222  hypothetical protein  31.73 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000808269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12960  hypothetical protein  32.67 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2621  hypothetical protein  31.73 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0879  hypothetical protein  30.96 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2978  hypothetical protein  33.73 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0096  hypothetical protein  33.86 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.387334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1203  protein of unknown function DUF34  35.17 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2208  hypothetical protein  32.54 
 
 		 259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171842  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01348  hypothetical protein  31.09 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2230  hypothetical protein  34.04 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0822184  normal  0.601423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1135  protein of unknown function DUF34  35.39 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.573001  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0343  hypothetical protein  33.6 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1581  hypothetical protein  32.13 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0168425 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0990  hypothetical protein  32.28 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2220  protein of unknown function DUF34  34.62 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.010099  normal  0.392171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2403  hypothetical protein  32.77 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01899  NIF3  34.66 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.134254  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0233  hypothetical protein  32.35 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0272688  normal  0.647258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1213  putative hydrolase-oxidase  32.03 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.522033  normal  0.0315512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0806  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.554338  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1131  hypothetical protein  35.44 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1254  putative hydrolase-oxidase  32.13 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.190885  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2073  hypothetical protein  31.37 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0758  putative hydrolase-oxidase  33.07 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2699  hypothetical protein  31.5 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0742132  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0819  putative hydrolase-oxidase  33.07 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2109  hypothetical protein  32.42 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0834  putative hydrolase-oxidase  33.07 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  hitchhiker  0.00118024 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0868  putative hydrolase-oxidase  33.07 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0735  putative hydrolase-oxidase  32.67 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2926  protein of unknown function DUF34  32.67 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0800  putative hydrolase-oxidase  32.67 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2945  putative hydrolase-oxidase  32.67 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2161  protein of unknown function DUF34  36.07 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.022584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0627  putative hydrolase-oxidase  32.67 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0725  putative hydrolase-oxidase  32.67 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.80137  normal  0.44707 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0771  putative hydrolase-oxidase  33.07 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.751383 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0758  putative hydrolase-oxidase  32.67 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00670  conserved metal-binding protein  32.67 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2744  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00659  hypothetical protein  32.67 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2178  hypothetical protein  31.85 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335063  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0480  hypothetical protein  31.76 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.333005  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0663  hypothetical protein  30.83 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>