283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2776 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2776  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  198  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  35.29 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  36.63 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  36 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2594  hypothetical protein  38.38 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325916  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  34.69 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  37.25 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  37.37 
 
 
113 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  35.29 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  35.35 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  34.95 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  30.3 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  32 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  36 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  32 
 
 
120 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0275  hypothetical protein  36.08 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.08475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  34.34 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  33.66 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  31.68 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  31 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  33 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  32.35 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  32.35 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  34 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00422  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000789262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  33 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0546  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00427  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000717849  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3145  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000177659  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0530  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.560508  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  34.69 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0548  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0978192  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0530  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0562  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140124  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0514  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0066094  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  33 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  34 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  33 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  32.35 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0509  hypothetical protein  32 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00428727  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  30 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  31.31 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  32.26 
 
 
105 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0255  hypothetical protein  38.3 
 
 
101 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287955  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  31.68 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  34 
 
 
104 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  30.21 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  31.37 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2253  hypothetical protein  31 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393048  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2325  hypothetical protein  31 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000151444  hitchhiker  0.000451117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  33.33 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  31 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  33 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2445  hypothetical protein  31.96 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775754  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  33 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  34 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2301  hypothetical protein  31 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  31.37 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  31 
 
 
108 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0269  hypothetical protein  38.46 
 
 
158 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0770  hypothetical protein  29 
 
 
108 aa  60.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.602979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  35.05 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  35.92 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  33 
 
 
108 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  30 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  30 
 
 
109 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  31 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  36.36 
 
 
112 aa  60.1  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2614  hypothetical protein  30 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000245202  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  30 
 
 
109 aa  60.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2573  hypothetical protein  30 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000212761  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2689  hypothetical protein  30 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000229424  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1770  hypothetical protein  30 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000205784  hitchhiker  0.00167408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2768  hypothetical protein  33 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  31.96 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  31.96 
 
 
101 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  35.35 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  31.96 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  28.16 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  29.9 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  29.25 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  32.97 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  36.56 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2322  hypothetical protein  36.19 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.424482  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  32 
 
 
108 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  30 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  29 
 
 
107 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  29.79 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0793  hypothetical protein  33 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0257165  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  28 
 
 
108 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.384172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>