26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2062 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2062  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  546  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2645  hypothetical protein  35.19 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.15753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3555  hypothetical protein  27.15 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  34.75 
 
 		 392 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2526  hypothetical protein  27.41 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0725  hypothetical protein  28.43 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3749  hypothetical protein  27.94 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0880  hypothetical protein  28.68 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00269663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0843  hypothetical protein  28.68 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00287209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1467  zinc carboxypeptidase-related protein  25.13 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3092  hypothetical protein  28.68 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00006748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3075  hypothetical protein  28.68 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000680371  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.74 
 
 		 606 aa  46.2  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  40.74 
 
 		 606 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3428  hypothetical protein  31.58 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0296042  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0908  hypothetical protein  31.58 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0933  hypothetical protein  31.58 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000499395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0942  hypothetical protein  28.68 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.878381  normal  0.502951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.21 
 
 		 618 aa  45.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  35.96 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.98 
 
 		 506 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1549  hypothetical protein  25.53 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.270462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1347  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.25 
 
 		 393 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  35.85 
 
 		 249 aa  42.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.82 
 
 		 218 aa  42.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>