115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33387 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009363  OSTLU_33387  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  100 
 
 		 385 aa  763    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48117  predicted protein  29.97 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36253  predicted protein  35.23 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38498  predicted protein  28.57 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0527  hypothetical protein  29.88 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000523356 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2538  lipoprotein transmembrane  32.11 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3906  bile acid:sodium symporter  31.21 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0585  lipoprotein transmembrane  29.64 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2427  bile acid:sodium symporter  28.49 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574524  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2407  Bile acid:sodium symporter  30.81 
 
 		 343 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3613  bile acid:sodium symporter  30.29 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423949  hitchhiker  0.00964207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2813  Bile acid:sodium symporter  30.28 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3818  bile acid:sodium symporter  32.65 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3716  Bile acid:sodium symporter  34.02 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0440669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0648  transporter, putative  29.03 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2501  bile acid:sodium symporter  32.23 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1899  Bile acid:sodium symporter  29.07 
 
 		 338 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3838  Na+-dependent transporter-like protein  30 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0525  bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 		 336 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1364  hypothetical protein  28.21 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.953103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0807  Bile acid:sodium symporter  29.53 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.308554 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0112  hypothetical protein  31.8 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0657186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0747  transporter, putative  28.61 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1861  hypothetical protein  35.24 
 
 		 332 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0673  lipoprotein transmembrane protein  27.66 
 
 		 342 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.74924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2103  Bile acid:sodium symporter  29.81 
 
 		 348 aa  93.6  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2148  bile acid:sodium symporter  31.15 
 
 		 344 aa  93.2  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0866  bile acid:sodium symporter  32.88 
 
 		 339 aa  92  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.299881 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2618  bile acid/Na+ symporter family protein  30.33 
 
 		 332 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2684  bile acid/Na+ symporter family transporter  29.77 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2660  transporter bile acid/Na+ symporter family  29.77 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2569  transporter, bile acid/Na+ symporter family  29.77 
 
 		 332 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000515206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4831  putative symporter family protein  31.32 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2937  bile acid:sodium symporter  29.1 
 
 		 331 aa  89.4  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.120648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3465  bile acid:sodium symporter  27.25 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2965  bile acid:sodium symporter  28.83 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2904  bile acid:sodium symporter  28.94 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.731183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0326  Bile acid:sodium symporter  29.68 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0453748 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2790  bile acid/Na+ symporter family transporter  29.1 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0532  sodium/bile acid symporter family protein  25.58 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0247  bile acid:sodium symporter  30.95 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0321  Bile acid:sodium symporter  30.24 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2770  sodium:bile acid symporter family protein  29.1 
 
 		 332 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3641  sodium:bile acid symporter family protein  29.1 
 
 		 332 aa  87  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000261961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0352  sodium/bile acid symporter family protein  26.71 
 
 		 346 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2565  bile acid/Na+ symporter family protein  29.1 
 
 		 332 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000897855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5029  hypothetical protein  30.23 
 
 		 330 aa  86.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1064  sodium/bile acid symporter family protein  30.59 
 
 		 321 aa  86.3  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1029  sodium/bile acid symporter family protein  30.59 
 
 		 321 aa  86.3  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02309  predicted inner membrane protein  29 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000832535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1252  Bile acid:sodium symporter  29 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000190028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3390  sodium/bile acid symporter family protein  26.71 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3064  sodium/bile acid symporter family protein  26.71 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2029  sodium/bile acid symporter family protein  26.71 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0339  sodium/bile acid symporter family protein  26.71 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2255  sodium/bile acid symporter family protein  26.71 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2544  bile acid/Na+ symporter family protein  29 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000983747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2697  bile acid/Na+ symporter family protein  29.1 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000209356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02270  hypothetical protein  29 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000838069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1269  bile acid:sodium symporter  29 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000908139  hitchhiker  0.000128844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04030  bile acid/sodium symporter  29.97 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3205  Bile acid:sodium symporter  30.58 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245995 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4379  bile acid:sodium symporter  30.1 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2714  bile acid:sodium symporter  30.42 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.476045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1125  Bile acid:sodium symporter  29.35 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4216  Bile acid:sodium symporter  29.21 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2880  bile acid:sodium symporter  27.91 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3017  bile acid:sodium symporter  27.91 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3255  bile acid:sodium symporter  30.5 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4937  Bile acid:sodium symporter  30.8 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1098  bile acid:sodium symporter  29.27 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.981697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6319  bile acid/sodium symporter  27.91 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2356  bile acid:sodium symporter  27.91 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2970  bile acid:sodium symporter  27.91 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2484  bile acid:sodium symporter  28.43 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.846841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3177  bile acid:sodium symporter  28.32 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98524  normal  0.0121029 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2990  bile acid:sodium symporter  27.91 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0302  sodium/bile acid symporter family protein  27.16 
 
 		 394 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2484  bile acid:sodium symporter  28.9 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2144  Bile acid:sodium symporter  28.96 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2382  bile acid:sodium symporter  29.41 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0916  lipoprotein transmembrane protein  29.29 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.800008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3262  hypothetical protein  28.42 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2034  Bile acid:sodium symporter  28.76 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2877  bile acid/Na+ symporter family protein  28.82 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2812  bile acid:sodium symporter  28.82 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.885659  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17200  predicted Na+-dependent transporter  31.58 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2738  hypothetical protein  28.32 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.889143  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3402  hypothetical protein  28.32 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2334  Bile acid:sodium symporter  27.8 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.87771  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4668  Na+-dependent transporter-like protein  29.72 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31146  predicted protein  23.58 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.815833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0427  Bile acid:sodium symporter  27.74 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4282  putative sodium/bile acid symporter family protein  28.28 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3442  bile acid:sodium symporter  28.52 
 
 		 330 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176045  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2649  bile acid:sodium symporter  30.25 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4465  bile acid:sodium symporter  28.48 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0152  bile acid:sodium symporter  27.13 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20925 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1880  putative sodium/bile acid symporter family protein  27.95 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2181  bile acid:sodium symporter  27.25 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>