128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0916 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0916  lipoprotein transmembrane protein  100 
 
 		 325 aa  652    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.800008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1899  Bile acid:sodium symporter  42.91 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4668  Na+-dependent transporter-like protein  42.22 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0673  lipoprotein transmembrane protein  41.14 
 
 		 342 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.74924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3838  Na+-dependent transporter-like protein  41.18 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2407  Bile acid:sodium symporter  37.46 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2538  lipoprotein transmembrane  41.07 
 
 		 358 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2813  Bile acid:sodium symporter  36.96 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3906  bile acid:sodium symporter  38.73 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0585  lipoprotein transmembrane  36.19 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2427  bile acid:sodium symporter  35.51 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574524  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0527  hypothetical protein  34.49 
 
 		 363 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000523356 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0112  hypothetical protein  35.56 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0657186 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0352  sodium/bile acid symporter family protein  36.53 
 
 		 346 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3390  sodium/bile acid symporter family protein  36.53 
 
 		 346 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3064  sodium/bile acid symporter family protein  36.53 
 
 		 346 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2029  sodium/bile acid symporter family protein  36.53 
 
 		 346 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0339  sodium/bile acid symporter family protein  36.53 
 
 		 346 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2255  sodium/bile acid symporter family protein  36.53 
 
 		 346 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0532  sodium/bile acid symporter family protein  36.53 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2990  bile acid:sodium symporter  37.3 
 
 		 343 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2484  bile acid:sodium symporter  36.83 
 
 		 331 aa  172  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.846841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3177  bile acid:sodium symporter  32.7 
 
 		 347 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98524  normal  0.0121029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6319  bile acid/sodium symporter  37.3 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2356  bile acid:sodium symporter  36.99 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2970  bile acid:sodium symporter  36.99 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3613  bile acid:sodium symporter  35.95 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423949  hitchhiker  0.00964207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2501  bile acid:sodium symporter  36.39 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4831  putative symporter family protein  35.38 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3017  bile acid:sodium symporter  37.11 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2103  Bile acid:sodium symporter  34.5 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2965  bile acid:sodium symporter  36.16 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0302  sodium/bile acid symporter family protein  35.6 
 
 		 394 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2880  bile acid:sodium symporter  37.11 
 
 		 347 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3262  hypothetical protein  35.19 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1098  bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.981697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0807  Bile acid:sodium symporter  34.18 
 
 		 357 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.308554 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0247  bile acid:sodium symporter  34.37 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3402  hypothetical protein  34.15 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2334  Bile acid:sodium symporter  35.88 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.87771  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3619  Bile acid:sodium symporter  35.13 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38320  bile acid/Na+ symporter family transporter  35.11 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0321  Bile acid:sodium symporter  33.54 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2738  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  159  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.889143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0747  transporter, putative  32.5 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0648  transporter, putative  33.75 
 
 		 342 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3320  Bile acid:sodium symporter  35.44 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2144  Bile acid:sodium symporter  33.02 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1064  sodium/bile acid symporter family protein  33.02 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1029  sodium/bile acid symporter family protein  33.02 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04030  bile acid/sodium symporter  32.6 
 
 		 334 aa  155  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4379  bile acid:sodium symporter  33.97 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2148  bile acid:sodium symporter  33.12 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3465  bile acid:sodium symporter  30.42 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4282  putative sodium/bile acid symporter family protein  35.44 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1880  putative sodium/bile acid symporter family protein  34.9 
 
 		 342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3818  bile acid:sodium symporter  33.55 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0427  Bile acid:sodium symporter  35.76 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0139  hypothetical protein  33.55 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0525  bile acid:sodium symporter  33.77 
 
 		 336 aa  152  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02309  predicted inner membrane protein  35.96 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000832535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1252  Bile acid:sodium symporter  35.96 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000190028  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2544  bile acid/Na+ symporter family protein  35.96 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000983747  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1994  hypothetical protein  34.56 
 
 		 342 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1269  bile acid:sodium symporter  35.96 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000908139  hitchhiker  0.000128844 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2770  sodium:bile acid symporter family protein  35.96 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264758  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02270  hypothetical protein  35.96 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000838069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2937  bile acid:sodium symporter  35.44 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.120648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2034  Bile acid:sodium symporter  34.55 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2266  putative sodium/bile acid symporter family protein  34.23 
 
 		 342 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3641  sodium:bile acid symporter family protein  35.96 
 
 		 332 aa  152  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000261961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1906  Bile acid:sodium symporter  34.38 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2565  bile acid/Na+ symporter family protein  35.96 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000897855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2697  bile acid/Na+ symporter family protein  35.96 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000209356  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4216  Bile acid:sodium symporter  34.88 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0152  bile acid:sodium symporter  33.65 
 
 		 340 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1364  hypothetical protein  31.06 
 
 		 340 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.953103  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5029  hypothetical protein  31.66 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3442  bile acid:sodium symporter  35.24 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176045  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2714  bile acid:sodium symporter  34.23 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.476045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2904  bile acid:sodium symporter  34.73 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.731183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2250  hypothetical protein  33.89 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2484  bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0866  bile acid:sodium symporter  34.15 
 
 		 339 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.299881 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2618  bile acid/Na+ symporter family protein  34.38 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2660  transporter bile acid/Na+ symporter family  36.1 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2569  transporter, bile acid/Na+ symporter family  36.1 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000515206  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2684  bile acid/Na+ symporter family transporter  36.1 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4465  bile acid:sodium symporter  34.46 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17200  predicted Na+-dependent transporter  33.01 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2790  bile acid/Na+ symporter family transporter  35.87 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0326  Bile acid:sodium symporter  32.97 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0453748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2877  bile acid/Na+ symporter family protein  34.38 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2812  bile acid:sodium symporter  34.38 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.885659  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4937  Bile acid:sodium symporter  31.76 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3205  Bile acid:sodium symporter  33.45 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2382  bile acid:sodium symporter  34.89 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3716  Bile acid:sodium symporter  32.86 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0440669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4204  bile acid:sodium symporter  34.75 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1125  Bile acid:sodium symporter  31.54 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>