116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2148 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2148  bile acid:sodium symporter  100 
 
 
344 aa  681    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1064  sodium/bile acid symporter family protein  87.03 
 
 
321 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1029  sodium/bile acid symporter family protein  87.03 
 
 
321 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3619  Bile acid:sodium symporter  65.84 
 
 
344 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3320  Bile acid:sodium symporter  66.45 
 
 
334 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5029  hypothetical protein  63.66 
 
 
330 aa  391  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2714  bile acid:sodium symporter  64.91 
 
 
331 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.476045  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3390  sodium/bile acid symporter family protein  57.49 
 
 
346 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0532  sodium/bile acid symporter family protein  57.49 
 
 
382 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3064  sodium/bile acid symporter family protein  57.49 
 
 
346 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2029  sodium/bile acid symporter family protein  57.49 
 
 
346 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0339  sodium/bile acid symporter family protein  57.49 
 
 
346 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2255  sodium/bile acid symporter family protein  57.49 
 
 
346 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0352  sodium/bile acid symporter family protein  57.89 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2965  bile acid:sodium symporter  58.7 
 
 
343 aa  329  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0112  hypothetical protein  53.31 
 
 
328 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0657186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2501  bile acid:sodium symporter  55.42 
 
 
324 aa  328  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3262  hypothetical protein  54.27 
 
 
333 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2697  bile acid/Na+ symporter family protein  54.49 
 
 
332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000209356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3641  sodium:bile acid symporter family protein  54.49 
 
 
332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000261961  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2484  bile acid:sodium symporter  55.48 
 
 
331 aa  325  7e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.846841  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2770  sodium:bile acid symporter family protein  54.49 
 
 
332 aa  325  7e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0302  sodium/bile acid symporter family protein  57.49 
 
 
394 aa  325  9e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02270  hypothetical protein  54.18 
 
 
332 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000838069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02309  predicted inner membrane protein  54.18 
 
 
332 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000832535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1252  Bile acid:sodium symporter  54.18 
 
 
332 aa  324  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000190028  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2544  bile acid/Na+ symporter family protein  54.18 
 
 
332 aa  324  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000983747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1269  bile acid:sodium symporter  54.18 
 
 
332 aa  324  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000908139  hitchhiker  0.000128844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3465  bile acid:sodium symporter  53.7 
 
 
348 aa  323  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.440703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38320  bile acid/Na+ symporter family transporter  56.27 
 
 
333 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277216 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2880  bile acid:sodium symporter  58.66 
 
 
347 aa  322  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2904  bile acid:sodium symporter  54.05 
 
 
334 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.731183  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2565  bile acid/Na+ symporter family protein  54.18 
 
 
332 aa  322  6e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000897855  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3017  bile acid:sodium symporter  58.36 
 
 
347 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3177  bile acid:sodium symporter  51.86 
 
 
347 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98524  normal  0.0121029 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2356  bile acid:sodium symporter  58.91 
 
 
343 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2970  bile acid:sodium symporter  58.91 
 
 
343 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6319  bile acid/sodium symporter  58.64 
 
 
343 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2990  bile acid:sodium symporter  58.64 
 
 
343 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0152  bile acid:sodium symporter  57.23 
 
 
340 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.20925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2144  Bile acid:sodium symporter  51.06 
 
 
333 aa  311  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2618  bile acid/Na+ symporter family protein  52.32 
 
 
332 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2660  transporter bile acid/Na+ symporter family  52.01 
 
 
332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2569  transporter, bile acid/Na+ symporter family  52.01 
 
 
332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000515206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3402  hypothetical protein  54.09 
 
 
329 aa  309  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431314  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4937  Bile acid:sodium symporter  56.19 
 
 
335 aa  309  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4282  putative sodium/bile acid symporter family protein  57.14 
 
 
342 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2334  Bile acid:sodium symporter  52.01 
 
 
329 aa  309  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.87771  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2738  hypothetical protein  54.09 
 
 
329 aa  309  5e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.889143  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2382  bile acid:sodium symporter  55.66 
 
 
330 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2937  bile acid:sodium symporter  52.52 
 
 
331 aa  308  9e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.120648 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2684  bile acid/Na+ symporter family transporter  51.7 
 
 
332 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68374  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2034  Bile acid:sodium symporter  52.32 
 
 
330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2790  bile acid/Na+ symporter family transporter  52.01 
 
 
332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2812  bile acid:sodium symporter  55.18 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.885659  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2877  bile acid/Na+ symporter family protein  54.79 
 
 
333 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3442  bile acid:sodium symporter  54.81 
 
 
330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176045  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0427  Bile acid:sodium symporter  58.79 
 
 
342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1906  Bile acid:sodium symporter  49.54 
 
 
331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3255  bile acid:sodium symporter  55.35 
 
 
332 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2250  hypothetical protein  51.37 
 
 
332 aa  299  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002288 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0866  bile acid:sodium symporter  51.65 
 
 
339 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.299881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0247  bile acid:sodium symporter  52.02 
 
 
324 aa  291  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4465  bile acid:sodium symporter  53.89 
 
 
333 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1880  putative sodium/bile acid symporter family protein  50.46 
 
 
342 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04030  bile acid/sodium symporter  49.09 
 
 
334 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1994  hypothetical protein  50.15 
 
 
342 aa  288  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2266  putative sodium/bile acid symporter family protein  49.85 
 
 
342 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3572  hypothetical protein  60.32 
 
 
328 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1098  bile acid:sodium symporter  52.41 
 
 
336 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.981697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0321  Bile acid:sodium symporter  50.31 
 
 
323 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.15131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3716  Bile acid:sodium symporter  47.5 
 
 
343 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0440669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4831  putative symporter family protein  51.88 
 
 
332 aa  269  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4216  Bile acid:sodium symporter  49.65 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0139  hypothetical protein  45.6 
 
 
326 aa  265  8e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0525  bile acid:sodium symporter  48.6 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4204  bile acid:sodium symporter  51.94 
 
 
330 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17200  predicted Na+-dependent transporter  48.71 
 
 
328 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0326  Bile acid:sodium symporter  44.73 
 
 
325 aa  257  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0453748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2484  bile acid:sodium symporter  46.95 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2649  bile acid:sodium symporter  55.3 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0527  hypothetical protein  43.12 
 
 
363 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000523356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2813  Bile acid:sodium symporter  43.89 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1364  hypothetical protein  43.84 
 
 
340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.953103  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4379  bile acid:sodium symporter  46.13 
 
 
322 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2407  Bile acid:sodium symporter  42.81 
 
 
343 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195437  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2538  lipoprotein transmembrane  42.07 
 
 
358 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0585  lipoprotein transmembrane  41.3 
 
 
341 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3205  Bile acid:sodium symporter  42.72 
 
 
328 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245995 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0807  Bile acid:sodium symporter  39.76 
 
 
357 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.308554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1125  Bile acid:sodium symporter  40.82 
 
 
341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2181  bile acid:sodium symporter  41.03 
 
 
323 aa  206  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2427  bile acid:sodium symporter  36.84 
 
 
335 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574524  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3613  bile acid:sodium symporter  38.87 
 
 
338 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423949  hitchhiker  0.00964207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0909  transporter, sodium/bile acid symporter family  45.8 
 
 
326 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.582064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1861  hypothetical protein  44.37 
 
 
332 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0440026  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0648  transporter, putative  41.11 
 
 
342 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3818  bile acid:sodium symporter  37.35 
 
 
332 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1899  Bile acid:sodium symporter  37 
 
 
338 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0747  transporter, putative  36.49 
 
 
342 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>