120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48117 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48117  predicted protein  100 
 
 		 429 aa  885    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38498  predicted protein  55.93 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36253  predicted protein  30.38 
 
 		 315 aa  134  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33387  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  29.97 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.307134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0648  transporter, putative  30.12 
 
 		 342 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2427  bile acid:sodium symporter  27.33 
 
 		 335 aa  110  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574524  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0747  transporter, putative  29.36 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0585  lipoprotein transmembrane  27.3 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2103  Bile acid:sodium symporter  29.81 
 
 		 348 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0807  Bile acid:sodium symporter  27.41 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.308554 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3818  bile acid:sodium symporter  29.11 
 
 		 332 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0527  hypothetical protein  25.54 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000523356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4668  Na+-dependent transporter-like protein  29.09 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4379  bile acid:sodium symporter  28.39 
 
 		 322 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3906  bile acid:sodium symporter  28.93 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31146  predicted protein  24.68 
 
 		 451 aa  97.8  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.815833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1899  Bile acid:sodium symporter  27.36 
 
 		 338 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0326  Bile acid:sodium symporter  26.65 
 
 		 325 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0453748 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0673  lipoprotein transmembrane protein  27.76 
 
 		 342 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.74924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3613  bile acid:sodium symporter  25.47 
 
 		 338 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423949  hitchhiker  0.00964207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3838  Na+-dependent transporter-like protein  29.29 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3619  Bile acid:sodium symporter  26.59 
 
 		 344 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3205  Bile acid:sodium symporter  26.62 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2538  lipoprotein transmembrane  24.3 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4216  Bile acid:sodium symporter  27.72 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2813  Bile acid:sodium symporter  26.36 
 
 		 343 aa  88.2  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17200  predicted Na+-dependent transporter  27.35 
 
 		 328 aa  87  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3320  Bile acid:sodium symporter  27.24 
 
 		 334 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4831  putative symporter family protein  28.82 
 
 		 332 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2407  Bile acid:sodium symporter  24.7 
 
 		 343 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0139  hypothetical protein  24.05 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0247  bile acid:sodium symporter  24.62 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2904  bile acid:sodium symporter  27.2 
 
 		 334 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.731183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2334  Bile acid:sodium symporter  25.93 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.87771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2144  Bile acid:sodium symporter  27.81 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2148  bile acid:sodium symporter  25.15 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2250  hypothetical protein  27.21 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2034  Bile acid:sodium symporter  25.59 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3177  bile acid:sodium symporter  23.97 
 
 		 347 aa  76.6  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98524  normal  0.0121029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1880  putative sodium/bile acid symporter family protein  26.91 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1994  hypothetical protein  26.91 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3262  hypothetical protein  26.23 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0112  hypothetical protein  25.22 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0657186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1125  Bile acid:sodium symporter  26.33 
 
 		 341 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2266  putative sodium/bile acid symporter family protein  26.58 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2937  bile acid:sodium symporter  25.53 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.120648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2181  bile acid:sodium symporter  23.1 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1906  Bile acid:sodium symporter  24.14 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2770  sodium:bile acid symporter family protein  24.17 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264758  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0532  sodium/bile acid symporter family protein  22.45 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3255  bile acid:sodium symporter  29.66 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3465  bile acid:sodium symporter  24.85 
 
 		 348 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2501  bile acid:sodium symporter  24.09 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1064  sodium/bile acid symporter family protein  25.47 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1029  sodium/bile acid symporter family protein  25.47 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2565  bile acid/Na+ symporter family protein  23.94 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000897855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2812  bile acid:sodium symporter  27.5 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.885659  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3641  sodium:bile acid symporter family protein  24.17 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000261961  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02309  predicted inner membrane protein  24.17 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000832535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1252  Bile acid:sodium symporter  24.17 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000190028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38320  bile acid/Na+ symporter family transporter  25.94 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02270  hypothetical protein  24.17 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000838069  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1098  bile acid:sodium symporter  25.39 
 
 		 336 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.981697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2544  bile acid/Na+ symporter family protein  24.17 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000983747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2697  bile acid/Na+ symporter family protein  24.17 
 
 		 332 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000209356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1269  bile acid:sodium symporter  24.17 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000908139  hitchhiker  0.000128844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2382  bile acid:sodium symporter  27.92 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2877  bile acid/Na+ symporter family protein  27.2 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3390  sodium/bile acid symporter family protein  23.43 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3064  sodium/bile acid symporter family protein  23.43 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2029  sodium/bile acid symporter family protein  23.43 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0339  sodium/bile acid symporter family protein  23.43 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2255  sodium/bile acid symporter family protein  23.43 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4465  bile acid:sodium symporter  27 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0302  sodium/bile acid symporter family protein  23.36 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2484  bile acid:sodium symporter  23.98 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.846841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2484  bile acid:sodium symporter  26.2 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284228  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2618  bile acid/Na+ symporter family protein  25.6 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2684  bile acid/Na+ symporter family transporter  25.68 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2660  transporter bile acid/Na+ symporter family  25.6 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2569  transporter, bile acid/Na+ symporter family  25.6 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000515206  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0352  sodium/bile acid symporter family protein  23.14 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0525  bile acid:sodium symporter  25.17 
 
 		 336 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3442  bile acid:sodium symporter  24.84 
 
 		 330 aa  67  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176045  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2307  putative cytochrome oxidase  25.42 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.992524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1364  hypothetical protein  22.87 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.953103  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0321  Bile acid:sodium symporter  21.75 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2790  bile acid/Na+ symporter family transporter  25 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4937  Bile acid:sodium symporter  23.97 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4204  bile acid:sodium symporter  25 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1861  hypothetical protein  24.11 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5029  hypothetical protein  22.92 
 
 		 330 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2714  bile acid:sodium symporter  25.1 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.476045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2880  bile acid:sodium symporter  22.55 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04030  bile acid/sodium symporter  22.92 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0866  bile acid:sodium symporter  24.89 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.299881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3017  bile acid:sodium symporter  22.32 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0152  bile acid:sodium symporter  23.03 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2738  hypothetical protein  24.23 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.889143  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3716  Bile acid:sodium symporter  25.8 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0440669 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>