25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0319 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0319  translin family protein  100 
 
 
204 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0681  translin family protein  30.35 
 
 
208 aa  102  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0808  haloacid dehalogenase superfamily protein  38.32 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.443987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0969  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.6 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0362  translin family protein  33.52 
 
 
223 aa  89  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.853538  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1365  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.37 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0955582 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_689  translin  28.65 
 
 
217 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518414  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0783  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.65 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0709  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.99 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1205  haloacid dehalogenase superfamily protein  31.32 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.598083  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0076  Translin  31.74 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.355906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0790  haloacid dehalogenase superfamily protein  35.16 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1705  Translin  27.98 
 
 
197 aa  77  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1128  haloacid dehalogenase superfamily protein  34.62 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3397  haloacid dehalogenase superfamily protein  27.37 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0034  haloacid dehalogenase superfamily protein  34.07 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1215  haloacid dehalogenase superfamily protein  28.93 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1692  Translin  26.23 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0856  haloacid dehalogenase superfamily protein  35.71 
 
 
196 aa  62  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1992  haloacid dehalogenase superfamily protein  23.26 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0751619  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0873  haloacid dehalogenase superfamily protein  34.44 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0624  haloacid dehalogenase superfamily protein  33.33 
 
 
190 aa  52  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1593  haloacid dehalogenase superfamily protein  34.41 
 
 
192 aa  51.6  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0637  haloacid dehalogenase superfamily protein  36.56 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.611822  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0473  haloacid dehalogenase superfamily protein  23.86 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000815699  hitchhiker  0.006759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>